Informace o projektu
Evoluce GC obsahu a genomu trav
- Kód projektu
- GP206/08/P222
- Období řešení
- 1/2008 - 12/2010
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- Poaceae, evoluce genomu, fylogeneze, velikost genomu, GC obsah, průtoková cytometrie, LTR retrotranspozony
Záměrem tohoto projektu je mapovat změny v obsahu GC bází (guaninu a cytosinu) související s fylogenezí druhů a globální evolucí genomu. Studium bude zaměřeno na modelovou čeleď Poaceae, vyznačující se nejvyšším a nejvariabilnějším GC obsahem v rámci vyšších rostlin, a bude postihovat všechny systematické úrovně, od rozdílů mezi čeleděmi, rody, druhy, až po vnitrodruhovou variabilitu. Dílčí studie jsou zaměřeny na: (i) sledování původu a následné evoluce vysokého GC obsahu genomu aa genů trav v rámci jednoděložných, (ii) sledování rozdílů v GC obsahu a velikosti chromozomů mezi hlavními evolučními liniemi trav, (iii) testování evolučního významu vysokého obsahu GC a následně vyšší termostability DNA pro rostliny z extrémních klimatických podmínek, (iv) prověření souvislosti změn obsahu GC s evolucí genomu v důsledku expanze a redukce mobilních elementů (na mezidruhové úrovni v rodě Oryza, na vnitrodruhové u Festuca pallens), a (v) na ověření možného využití měření obsahu GC a velikosti genomu pro mapování těchto procesů.
Publikace
Počet publikací: 14
2008
-
GC content, genome size and chromosome size evolution in grasses and other monocots
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
-
Genome size in Cyperaceae
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
-
Intrapopulation genome size dynamics in Festuca pallens
Annals of Botany, rok: 2008, ročník: 102, vydání: 4
-
Quantification of retrotransposon in Festuca pallens population varying in genome size
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty