Project information
SUMO a stability genomu
- Project Identification
- GA13-26629S
- Project Period
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D.
- Mgr. Veronika Altmannová, Ph.D.
- Mgr. Peter Kolesár, Ph.D.
- Dr. Emil Damyanov Parvanov
- Mgr. Marek Šebesta, Ph.D.
Integrita genomu je neustále narušována poškozením DNA. Dvouřetězcové zlomy v DNA (DSB) představují jeden z nejtoxictějších typů poškození DNA, které, pokud zůstanou neopraveny, mohou vést k aneuploidii, genetickým aberacím nebo
buněčné smrti. Existují dva hlavní DSB opravné mechanismy, zahrnující homologní rekombinaci (HR) a nehomologní spojování
konců (NHEJ). Cílem tohoto projektu je identifikace sumoylovaných proteinů podílejících se na HR, charakterizovat vliv
sumoylace na jejich funkci se zaměřením na SSA dráhu HR. S použitím hmotnostní spektrometrie identifikujeme SUMO
konjugační místa, což nám umožní vytvořit sumo-deficietní mutanty a testovat jejich vliv in vivo. Široká škála biochemických
metod dostupných v naší laboratoři nám umožní určit vliv sumoylace na protein-proteinové interakce a biochemické vlastností
proteinů podléhajících sumoylaci. Pochopení úlohy sumoylace v jenotlivých krocích opravy DSB a jejich molekulárních
mechanizmů může představovat nový nástroj k potenciálnímu terapeutickému využití.
Publications
Total number of publications: 38
2016
-
The structure and DNA-binding properties of Mgm101 from a yeast with a linear mitochondrial genome
Nucleic Acids Research, year: 2016, volume: 44, edition: 5, DOI
-
Yeast mitochondrial HMG proteins: DNA-binding properties of the most evolutionarily divergent component of mitochondrial nucleoids
Bioscience Reports, year: 2016, volume: 36, edition: 1, DOI
2015
-
Interaction of RECQ4 and MCM10 is important for efficient DNA replication origin firing in human cells
Oncotarget, year: 2015, volume: 6, edition: 38, DOI
-
Local regulation of the Srs2 helicase by the SUMO-like domain protein Esc2 promotes recombination at sites of stalled replication
Genes and Development, year: 2015, volume: 29, edition: 19, DOI
-
MEK and TGF-beta Inhibition Promotes Reprogramming without the Use of Transcription Factor
Plos one, year: 2015, volume: 10, edition: 6, DOI
-
Rad51 Paralogs Remodel Pre-synaptic Rad51 Filaments to Stimulate Homologous Recombination
Cell, year: 2015, volume: 162, edition: 2, DOI
-
RECQ4 selectively recognizes Holliday junctions
DNA Repair, year: 2015, volume: 30, edition: "neuvedeno", DOI
-
Srs2 promotes Mus81-Mms4-mediated resolution of recombination intermediates
Nucleic Acids Research, year: 2015, volume: 43, edition: 7, DOI
-
Sumoylation Influences DNA Break Repair Partly by Increasing the Solubility of a Conserved End Resection Protein
PLoS Genetics, year: 2015, volume: 11, edition: 1, DOI
-
Sumoylation regulates EXO1 stability and processing of DNA damage
Cell Cycle, year: 2015, volume: 14, edition: 15, DOI