Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Informace

Projekt nespadá pod Přírodovědeckou fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

NR8967

Období řešení

1/2006 - 12/2009

Investor / Programový rámec / typ projektu

Ministerstvo zdravotnictví ČR

Resortní program výzkumu a vývoje - MZ

Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Klíčová slova

Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy

Spolupracující organizace

Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno

Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská

Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.

Publikace

Počet publikací: 90

2012

Molekulární detekce syfilis, kmenová typizace a stanovení makrolidové rezistence u původce syfilis - Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu.

MIKALOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2012, druh: Konferenční abstrakty

2010

Celogenomové restrikční mapování u vybraných zástupců rodu Treponema.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S. J. SODERGREN E. WEINSTOCK G. M.

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Celogenomové restrikční mapování u 8 zástupců rodu Treponema.

MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Clarithromycin treatment failure due to macrolide resistance in Treponema pallidum in a patient with primary syphilis.

WOZNICOVÁ Vladana ŠMAJS David POSPÍŠILOVÁ Petra ZÁKOUCKÁ Hana DASTYCHOVÁ Eliška FLASAROVÁ Magdalena VALIŠOVÁ Zuzana

Článek v odborném periodiku

Acta Dermato-Venereologica, rok: 2010, ročník: 90, vydání: 2
Complete genome sequence of T. paraluiscuniculi, strain Cuniculi A: an evidence for adaptation of T. paraluiscuniculi to rabbits.

ŠMAJS David STROUHAL Michal ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina DUGAN-ROCHA S. POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S.J. ALBERT T. QUIN X. HALLSWORTH-PEIN K. WEINSTOCK G.M.

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Genome analysis of Treponema pallidum subsp. pallidum and subsp. pertenue strains by whole genome fingerprinting: most of the genetic differences are localized in six genomic regions.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S.J. SODERGREN E. WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Článek v odborném periodiku

PloS ONE, rok: 2010, ročník: 5, vydání: 12
Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Molecular characterization of clinical isolates of Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.

POSPÍŠILOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena ZÁKOUCKÁ H. WOZNICOVÁ Vladana WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.

POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
Najvirulentnejší zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.

MIKOLKA Pavol POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty